Mesleki yaşamı boyunca özel bir hastanede binlerce hastaya şifa dağıtan Dr. Aydoğan, bir süredir sağlık sorunları nedeniyle tedavi altındaydı. Durumunun ağırlaşması üzerine kaldırıldığı hastanede doktorların tüm çabalarına rağmen kurtarılamadı.
Söke’de tıp camiasında iz bırakan isimlerden biri olan Aydoğan’ın vefatı, ilçe halkı ve meslektaşları arasında büyük üzüntü yarattı.